埃里克·阿尔姆 (Eric Alm) 麻省理工学院实验室里的一个厕所,对微生物学的贡献超过了大多数浴室。在 2009 年的大部分时间里,这位生物学家用它来收集自己的粪便进行分析。
这项研究(也涉及一位同事)听起来可能很简单,如果说有点恶心的话,但肠道微生物的变化(称为人体微生物群)非常复杂。通过跟踪粪便样本中微生物群的变化,阿尔姆希望更多地了解饮食、睡眠和锻炼等日常活动如何与这些微生物群落的变化相关联。
说服他的同事相信这是一项值得进行的实验是一项挑战,但一旦数据出来,热情就会高涨。大约进行到一半时,阿尔姆在一次用餐彻底改变了他的肠道细菌的组成后,了解了自己饮食的重要性。从科学的角度来看,食物中毒为这项研究提供了一个意想不到的——但并非完全不受欢迎的——变量。

麻省理工学院生物学家埃里克·阿尔姆 (Eric Alm) 每天采集粪便样本,持续了近一年 -- 通常使用他在马萨诸塞州剑桥市的实验室的厕所。 | Joanne Rathe/The Boston Globe/Getty Images
亲述
我们只是想测试什么可以调节微生物群。我把这个想法提出来,得到了大家非常消极的反应,直到我和一位同事谈了谈,他当时说:“你不知道我有多兴奋。”人们要么超级兴奋,要么就像“不,这听起来太可怕了。”
那时,我们只有粪便帽——挂在厕所上的小桶。从那个样本中,你舀出一小块粪便,放进试管,然后放进冰箱里。这就是协议。我的妻子坚决否决在家储存样本,所以大多数周末,我都会开车去办公室排便。
有一天,我得了沙门氏菌中毒。我们追溯到法式吐司。可能有一些未煮熟的鸡蛋。我去了急诊室,医生认为这是病毒,所以我只输了一些静脉注射液。(诊所采集了样本,并在我离开并开始康复后,确认它是沙门氏菌。)我从未接受过抗生素治疗。这真是太可怕了。你感觉自己快要死了。
你跟踪两个人一年,你看到像食物中毒这样令人兴奋的事情的机会非常低。一旦我们得到它,从科学的角度来看,这是一个巨大的福音。我收到了很多来自同事的祝贺邮件。他们知道我会多么兴奋。
我们现在正在努力做的是引入大量患有炎症性肠病 (inflammatory bowel disease) 的患者,并对他们进行类似的跟踪。目标是预测人们何时会出现突发状况,并为他们带来个性化医疗。
我肯定会再次进行这项研究。我仍然有时会做法国吐司。















