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数千种新的微生物物种被发现生活在人体上

在人体微生物组中发现了数千种新物种,主要来自非西方化人群,揭示了健康方面的见解。

作者:Roni Dengler
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微生物几乎存在于人体的每一个部位。如今,科学家们已大大扩展了已知物种的列表。来源:Darryl Leja/NHGRI

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在这项同类规模最大的研究中,科学家们发现了数千种栖息在人体微生物组中的新物种——微生物组是我们体内大量细菌、病毒和其他微生物的集合,它们遍布我们全身,影响着我们的健康。而且,新发现的这些微生物大部分生活在非西方化人群的体内和体表。研究人员表示,这一发现重新定义了科学家对人体微生物组的理解,并可能为西方化世界中日益增长的过敏、自身免疫性疾病和其他复杂综合征的发生率提供线索。

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意大利特伦托大学计算基因组学家Nicola Segata表示:“我们的人体微生物组与人类共同进化了数百万年,但最近向西方化生活方式的转变,包括日益卫生的条件、抗生素和其他药物的普及,以及高脂肪饮食的引入,可能对我们的肠道微生物组产生了影响,进而影响了人类-微生物共生关系。”

缺失的微生物

尽管近期有大量关于人体微生物组的研究,但专家们清楚地认识到,许多微生物物种仍然隐藏在人体微生物组中,不为人知。

Segata说:“当使用最先进的DNA测序仪对个体肠道微生物组的遗传内容进行测序时,我们和其他人发现,机器产生的DNA片段中有很大一部分与任何已知微生物的基因组都不匹配。”“因此,人体微生物组的许多DNA是‘无法映射’的。”

Segata和他的同事们希望尽可能多地“映射”人体微生物组。因此,研究人员从大型、公开可用的数据集以及他们收集的新数据中,汇编了一个包含超过154,000个微生物基因组的目录。该清单包括来自32个国家、所有年龄段人群的皮肤、粪便、阴道和口腔的样本。其中七个数据集来自非西方化人群,包括蒙古的传统农牧群体、坦桑尼亚的哈扎特猎人采集者和一个传统的斐济人口。

当研究人员分析新目录时,他们发现了近5,000种微生物物种,其中77%是全新的,研究团队今天在《细胞》杂志上报告了这一发现。

Segata说:“我们希望能找到一些之前未被探索过的物种。但其数量和普遍性……超出了我们的初步预期。”研究人员估计,其中一种新物种是人体微生物组中第七大常见的肠道微生物。

紊乱导致的疾病

他们发现,非西方化人群包含大量新物种。该团队怀疑这是因为这些人群过去的研究较少,并且他们的生活方式比西方化人群更能促进肠道多样性。

加州大学圣迭戈分校的微生物学家Jack Gilbert(未参与此项新研究)想知道是什么驱动了这些差异。Gilbert说:“是什么生态进化驱动力……选择了在印度南部人群中发现的细菌物种及其功能,而不是在德国人群中发现的?”有了Segata研究的结果,Gilbert等专家现在可以开始回答这些问题。

对于Segata来说,这些结果也引发了其他问题。他推测,非西方化人群的微生物组类似于前西方化时代的微生物组。他表示,研究这些新物种——特别是那些在非西方化人群中普遍存在的物种——可能有助于科学家们“理解与微生物组与人体之间共生关系紊乱相关的疾病。”

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