当我们听说有人有了新宝宝时，第一个问题通常是“是男孩还是女孩？” 但当我们听说有人有了新小狗时，第一个问题通常是“它是什么品种？” 品种是我们如何看待狗的核心。它或多或少地影响我们对它们的许多期望——精力水平、智力、友善程度。然而，对于杂交狗来说，我们根据品种做出假设的冲动可能会因为缺乏已知的品种来附着这些假设而受阻。所以当你有一只杂交狗（就像我一样），你学会玩“它是什么？”的游戏。有些人猜，有些人编造巧妙的名字（我有一只金毛牧羊犬，有时是边境寻回犬）——有些人则对他们的狗进行基因检测以确定其血统。一个新项目 MuttMix，为您提供杂交狗的照片、视频和行为趣闻，让您尽情玩“它是什么？”的游戏，造福科学。卡尔森实验室，隶属于 麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所，已与 国际动物行为顾问协会 (IAABC) 合作，试图找出人们在猜测美国杂交狗的混血品种方面到底有多擅长。我们不会立即公布答案，因为我们希望确保在人们进行猜测时没有人拥有特权信息，但该项目将于 6 月 16 日结束，之后我们将公开这些混血品种（并开始撰写期刊文章！）。该项目今天启动，所以快去开始猜测吧！
MuttMix 背后的品种识别算法由 Linda Boettger 博士在布罗德研究所担任博士后期间设计。Linda 获得了人类基因组学研究的博士学位，毕业后认为将其中一些方法应用于狗会很有趣。她解释说：“狗确实是终极模型系统，因为它们是形态最多样的哺乳动物物种，并且在外观和行为方面都受到了强烈的选择压力。此外，Elinor [卡尔森实验室负责人] 告诉我，我可以通过写大量代码来找出我的狗的品种血统！” Linda 从收容所领养了她的狗 Skyler，收容所告诉她 Skyler 是拉布拉多/比特犬的混血，但 Linda 发现 Skyler 实际上是多种品种的混血，主要是斑点狗和罗威纳犬，这让她很感兴趣。（不幸的是，Skyler 在几个月前去世了，但她在 2017 年卡尔森实验室假日贺卡上永垂不朽）。为了测试她的算法，Linda 需要具有高度混血血统的杂交狗，但她还需要确切知道这些血统是什么——这种情况在现实世界中很难遇到。所以她转向软件模拟交叉，使用真实的纯种狗基因组来查看它们的幼犬基因组可能是什么样子。她持续进行这些模拟多代，直到得到具有多种品种血统的杂交狗，类似于 MuttMix 项目中涉及的真实狗。Linda 的 MuttMix 品种识别算法“描绘”出每个染色体中源自特定品种的部分。以 Lucky 为例，一只与我们实验室成员之一同住的杂交狗，它的每个染色体片段都追溯到各种不同的品种。通过“描绘”每个染色体片段的相关品种遗传，我们可以准确地看到 Lucky 从何处获得了构成其独特外观的特征——来自玩具贵宾犬祖先的垂耳，来自拉萨犬的男性胡须（或“装饰”）。我们甚至可以预测 Lucky 在高海拔环境中表现良好，因为他从适应高海拔的拉萨祖先那里获得了一个突变。我们帮助 MuttMix 的公民科学家可能会证明我们是错的，但我们希望表明，仅仅通过观察狗来猜测它的品种实际上是相当困难的，即使有一些视频和行为描述来帮助他们。我们都知道，在某种程度上，每只狗都是一个个体，但有时我们会忘记这一点，当我们回忆起我们遇到的上一只金毛猎犬是多么活泼，并看到我们面前的黄狗与那只狗有多么相似时。即使在同一个品种内，犬类的性格也大相径庭。通过 MuttMix，我们希望能够提供一些确凿的科学证据，证明你不能以貌取狗。但也许你会证明我们是错的，所以请访问 MuttMix，看看我们为您准备的各种可爱的杂交狗，并给出您最好的猜测！客座文章作者：Jessica Hekman，DVM，PhD，麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的博士后，除了专注于她自己的研究《工作犬项目》外，她还协助像 MuttMix 这样酷炫的项目。Jessica 有一只杂交狗 Jenny，它的 DNA 正在测序中，她迫不及待地想看看 Linda 的品种识别算法会对此有何看法。@dogzombieblog / facebook.com/dogzombieblog
