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科学家们制定了一项技术路线图,说明他们需要什么才能从头开始编写合成基因组

探索推动基因组写入计划的合成生物学进展,以合成整个基因组并彻底改变科学。

作者:Alex Orlando
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艺术创作,展示大数据应用于 DNA。图片来源:Zita/Shutterstock

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起初,只有孟德尔和几株豌豆。在接下来的 150 年里,染色体配对被标记,A、T、C 和 G 被配对,最终,30 亿个碱基对被按正确顺序测序。经过被称为人类基因组计划的十年全球努力,生命遗传蓝图终于被勾勒出来。

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现在,一群科学家正在齐心协力追求一个同样广泛、多学科的目标:能够编写和测试整个基因组。

在一篇发表于《Science》杂志上周四的文章中,一群研究人员概述了一项技术路线图,旨在实现未来将合成整个基因组像今天进行 DNA 测序一样普遍。该路线图是基因组写入计划(Genome Project-write)的一部分,该计划正在协调全球科学家合成不同生物 DNA 的努力。作者们表示,这种设计整个基因组的能力将彻底改变医学、农业、工业等领域。

漫漫长路

合成生物学——一个将工程原理应用于生物学的领域——在过去十年中取得了飞速发展。DNA 测序公司大量涌现。科学家们发现了可以编辑活体生物基因的新分子工具。

但文章的作者们,包括哈佛大学基因组学先驱乔治·丘奇(George Church),表示我们尚未完全了解合成生物学的全部范围和潜力。通过操纵生命编码来创造器官、治愈疾病或培育营养丰富的农作物的可能性似乎近在咫尺。然而,作者们认为,在我们完全掌握这种基因编辑的未来之前,仍有重大的技术障碍需要克服。

哈佛医学院遗传学研究员、该论文的首席作者 Nili Ostrov 表示:“我们(理论上)有能力制造合成基因组。我们只是还没有将所有(目前存在的)工具整合起来。”

作者们确定了实现这一潜力所需的四项主要技术发展领域:基因组设计、DNA 合成、基因组编辑以及创建可引入细胞的合成染色体。他们表示,后一项,即拼接所有 DNA 片段以构建功能性染色体,可能是最难克服的。

Ostrov 表示:“(这些领域)中的每一个都有其挑战。但最需要基础性发展和新方法的是[染色体构建]。”

这些领域内特定技术进步的估计时间范围——例如,设计一种防病毒的染色体——在两年到十年之间。作者们也承认,与更成熟的领域相比,合成基因组学仍处于起步阶段。这意味着任何关于时间线和成本的预测都仍然“高度推测性”。

  • Alex Orlando

    Alex 是《发现》杂志的高级副编辑。在2019年加入《发现》团队之前,他曾担任《半月湾评论》的记者和休斯顿德克萨斯医学中心的特约撰稿人。他的作品也曾发表在《The Verge》和《旧金山杂志》上。Alex 拥有加州大学伯克利分校新闻学硕士学位。

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