来源： Nature (2013) doi:10.1038/nature12228 我偶尔会被问及“嗜水猿假说”。我的标准回答是没什么好看的，大家都应该继续前进。但是，读了《自然》杂志上的一篇新（开放获取）论文《类人猿的遗传多样性与种群历史》，它又浮现在我脑海中。原因是图1说明中的这一段：“桑纳加河将尼日利亚-喀麦隆与中非黑猩猩种群分隔开来，而刚果河则将倭黑猩猩种群与中非和东非黑猩猩分开。” 我知道后者的分隔。前者对我来说是新信息。事实上，在这篇论文之前，我从未听说过桑纳加河。虽然刚果河显然是一个重要的地理和水文实体，但我对桑纳加河不太确定。尼日利亚-喀麦隆黑猩猩与刚果西部黑猩猩之间的分隔可能是一个原因过多的例子。
尽管如此，将这些河流特征视为产生异域物种形成和亚种级别差异的既定参数，我仍然对我们与我们的表亲之间的对比感到震惊。
特别是，上面的系统发育树似乎表明倭黑猩猩和普通黑猩猩在大约 200 万年前分化，而尼日利亚-喀麦隆种群则在距今 50 万年前（取决于你依赖的推断方法，尽管这里定性的见解即使你调换它们也得以保留）与刚果西部种群分离。尽管是智人（H. sapiens sapiens）打破了走出非洲-欧亚大陆的“世界岛”，但即使是我们的直立猿人表亲，也在 100 万多年前就向欧亚大陆的东南端推进了。由此看来，我们的草原猿谱系以漫游癖和不怕水的行为为特征。
总的来说，这篇论文很重要，因为它在基因组（在同一假定标记上命中基因组超过 10 次）和种群（采样了广泛的类人猿亚种，N = 79）方面具有合理的覆盖范围。未来，这类分析可能会变得平淡无奇，用一把瑞士军刀般的统计基因组分析技术来剖析丰富的数据集（参见补充 PDF）。如果你对黑猩猩复杂的种群历史感兴趣，这篇论文就是为你准备的，因为它探讨了种群规模的变化以及混杂和基因流动。对我来说，有两个非常重要的重大发现。第一，他们没有发现人类谱系中丢失功能（loss of function）的取代物被富集。这一点很重要，因为遗传学家仍在寻找“使我们成为人类的基因”。或者更善意地说，寻找我们物种特有的、导致我们独一无二的进化过程。我并不否认我们是一个独特的物种，但这似乎表明，这场追寻还将持续一段时间。这是因为
或许我们的遗传基因或进化起源并没有什么独一无二的之处。
事实上，如果研究人员得出结论，在过去 200 万年里，普遍的趋势适用于所有的人属（Homo），而不是如今所有人类的祖先（因为其他谱系已经灭绝）的那个子集，我并不会感到惊讶。第二，请注意其他类人猿的遗传多样性范围有多么多样。这一点已经被大家普遍知晓一段时间了，但“人类作为类人猿来说遗传同质性很高”这种老套的说法，存在着将不同种群汇集并取平均值的问题。黑猩猩的杂合性范围非常大。实际上，某些人类种群的遗传多样性比其他几种猿类种群还要高。此外，请注意这些猿类亚种相当深的种群分化。倭黑猩猩-黑猩猩的分裂发生在我们人属（Homo）产生的同时，但普通黑猩猩亚种的谱系开始分化，大约与古人类（archaic Homo）种群出现的时间差不多。简单来说，这意味着在普通黑猩猩中存在与尼安德特人与非洲人类之间分化深度相同的种群结构。在不久的将来，这类分析将扩展到其他哺乳动物类群。但一如既往，猿类优先，其他类群随后。
