
我周末将在渥太华度过,那里有两千多名科学家聚集参加进化生物学联合大会。我正沉浸在大量引人入胜的讲座中,内容涵盖从性食同类蟋蟀到亚马逊生物多样性未来的方方面面。晚上,会议将举行高水平的讲座——周五晚上,科学作家大卫·夸门(David Quammen)在他获得史蒂芬·杰·古尔德奖之际,回顾了他的职业生涯。我对今晚的讲座特别感兴趣,甚至想进行现场直播。演讲者是罗茜·雷德菲尔德(Rosie Redfield),她将谈论令人着迷的砷生命案例。在雷德菲尔德晚上7:30(东部时间)登台之前,我想写一篇简短的前言。2010年12月,关于NASA发现外星生命的传言流传了几天。当他们最终召开新闻发布会时,全世界才得知,一个科学家团队在加利福尼亚的莫诺湖发现了一种似乎能够利用砷构建DNA的细菌。如果属实,这将是地球上任何已知生命都无法比拟的。英属哥伦比亚大学微生物学家罗茜·雷德菲尔德(Rosie Redfield)在《科学》(Science)杂志的禁令解除后阅读了该论文,并且不喜欢它。在她发布的博客上表达了她的不满后,我联系了她以及其他一些科学家,看看他们的想法。他们中的大多数也不喜欢这篇论文。我在《石板》(Slate)杂志上的一篇文章中报道了他们的集体反应,文章标题是《这篇论文不应该被发表》。(这是我与一位科学家交谈时的引述。)这篇论文的作者们,他们愿意举行大型新闻发布会、进行TED演讲等等,却拒绝给我任何评论。他们声称所有讨论都必须限制在同行评审的渠道中。六个月后,《科学》杂志终于在印刷版上发表了砷生命论文,同时也发表了雷德菲尔德和其他批评者的一些评论。雷德菲尔德等人认为,砷生命研究执行不力。要检验一个科学断言,批评者可以尝试重复它。但是,正如我在《纽约时报》上写的,这很麻烦,许多研究人员宁愿花宝贵的时间做一些有趣的事情,而不是清理别人的烂摊子。但雷德菲尔德还是决定重复砷生命的研究。她还有另一个动机:她是开放科学的忠实拥护者,于是她通过自己的博客记录了她的经历,从收到原始作者的细菌,到未能重复他们的结果,再到将她的论文发布到Arxiv,最后到论文被《科学》杂志接受并即将出版。正如雷德菲尔德在她的博客上指出的,今晚的讲座给传统的高影响力期刊发表论文的方式带来了一定的复杂性。像《科学》这样的期刊对论文实行严格的禁运,这意味着人们在指定时间之前应该保持沉默。《科学》杂志通常会提前一周向记者提供论文的预印本,以便他们撰写文章,在禁运解除时发布。所以……如果雷德菲尔德谈论她的研究,这对她的论文意味着什么?而你已经可以从Arxiv下载了,这是否会让这一切都变得无关紧要?敬请关注!7:36:开始。雷德菲尔德正在被介绍。7:38:“罗茜·雷德菲尔德引领了NASA的指责,认为他们搞错了。”7:41 雷德菲尔德开始:这是一个关于科学过程的故事,它始于新闻发布会。7:42 雷德菲尔德简要提到了NASA发现外星生命的那一周令人难以置信的猜测。嘿,她是一名微生物学家。7:43 为什么这样做?“研究人员正在寻找他们发现的东西。”(在科学中并非总是好事。)7:44:寻找外星生命成本很高。所以NASA正在寻找有助于搜寻的地球生命。7:44:2009年《天体生物学》杂志上的一篇论文:砷生命团队指出,砷与磷相似。所以也许早期生命可以使用砷代替磷(例如在DNA中)。而且也许它们仍然存在。7:45:生命的起源。你可以从早期地球向前推断,或者从今天的生命回溯,来弄清楚第一个生命必须拥有什么。7:46:早期地球:简单的化学物质产生了复杂的物质。此外,早期地球“有臭味”。7:47 彗星带来了脏水,里面充满了多环芳烃。7:48 当今所有生命都相互关联。所有生命都源于一个共同祖先。7:50 当今所有生命的共同祖先:DNA基因组、细胞结构、脂质双层、蛋白质合成、许多现代生化途径。7:51 从地球前生命到最后通用祖先之间,科学家们仍有一个尚未跨越的鸿沟。7:52 活着的生物需要具备哪些特性?繁殖、遗传以及影响生存或繁殖的可遗传变异。雷德菲尔德:“这概括了自然选择。”7:53 自然选择可能在最后通用祖先出现很久之前就已经开始了。第一个生命可能具有更简单的代谢。可能不基于DNA。生命可能始于RNA。(看看我为《探索》杂志写的这篇故事。)7:55 今天,蛋白质完成了大部分新陈代谢工作。7:57 创造论者抓住了这个开放性问题。进化生物学家声称进化不包括生命的起源。但RNA世界通过进化,更接近起源。7:58 回到砷:有毒,因为细胞有时会吸收砷,从而扰乱事物。7:59 “影子生物圈”——一个很酷的名字,但几乎肯定是不正确的。8:00 影子生物圈假说:奇怪的生命即使在今天也存在,隐藏在科学家们看不到的地方。雷德菲尔德:“这非常酷。”8:01 雷德菲尔德总结了砷生命实验。莫诺湖的细菌在砷代替培养基中的磷后继续生长。8:02 一旦Felisa Wolf-Simon能够培养细菌,她就邀请了其他科学家。复杂的测试,如NanoSIMS,以显示砷在(或接近)砷中。8:04 奇怪的是,《科学》杂志刚刚在未经通知记者的情况下,在其网站上发布了雷德菲尔德的论文,以及另一篇记录未能重复的论文。8:05 雷德菲尔德表示怀疑。鉴于火星陨石的混乱局面,NASA的往绩并不好。8:06 每当雷德菲尔德想仔细思考某事时,她都会在博客上写下来。8:07 关于砷生命的官方新闻稿刚刚发布。有两篇论文驳斥了它。8:09 雷德菲尔德:砷生命培养基中含有少量磷酸盐——与海水相同。8:11 砷细菌变胖了。它们无法再分裂,所以膨胀了。8:13 雷德菲尔德认为,砷生命细菌的DNA本身已经混入了砷——砷不是DNA的一部分。8:15 《今日美国》的Dan Vergano正在报道新论文。砷生命论文的首席作者Felisa Wolf-Simon宣称:“这些新论文的数据中没有任何内容与我们已发表的数据相矛盾。”8:17 我忘了链接到我收集的许多批评者的回应数据库。在这里。8:18 出于某种原因,有些人嘲笑雷德菲尔德染过的头发。目前她只是灰色的。8:19 DNA中的砷会非常迅速地分解。这是一个大问题。8:19 砷生命论文中的细菌不是影子生物圈的一部分。它只是一个已知的菌属Halomonas的成员。8:21 这种名为GFAJ-1(Get Felisa Wolf-Simons A Job)的细菌,与其他的Halomonas非常非常相似。为了变成砷生命,并没有太多奇异的进化。8:22 没有理由认为会有选择砷的自然选择,因为莫诺湖含有相当多的磷(尽管砷含量也很高)。8:24 NASA突然从大型新闻发布会转为沉默。Felisa Wolf-Simon“一直在疯狂地发推文”。8:25 新闻发布会六个月后,论文发表,同时附带批评。作者的回应:“我们认为我们的研究很好。”——雷德菲尔德。8:27 雷德菲尔德关注砷生命的原因是“自私的”:她会在博客上写下自己的工作,追求开放科学。让公众看到科学是如何进行的很重要。8:29 雷德菲尔德缺乏尝试重复砷生命所需的所有专业知识。博客文章促成了与能够完成这项工作的专家的合作。(实际上,他们主动提供了他们的研究生!)8:30 雷德菲尔德花了一个月时间试图培养细菌,一路博客记录。氨基酸出了问题。最终,她解决了这个问题。8:32 雷德菲尔德使用了含有极少磷酸盐的更好试剂。砷并没有帮助生长。砷生命团队错了。8:33 她的DNA稳定了几个月。里面不可能有砷。8:35 雷德菲尔德等人写了一篇论文,提交给《科学》,并上传到Arxiv——因为这是开放科学。8:36 《科学》计划在7月26日出版。8:36 期刊使用禁运来控制研究的宣传方式。想了解更多,请阅读Embargo Watch。8:38 禁运由“含糊的威胁”执行。8:38 论文已在Arxiv上发布数月,而《科学》却还在执行禁运,这很奇怪。雷德菲尔德得知禁运将于今晚解除。8:39 我刚告诉雷德菲尔德她的论文已经挂在网上半小时了。掌声响起。8:40 雷德菲尔德:这是一个系列失败的故事。首席作者确信证据,但研究不充分;高级作者没有提供监督。合著者应该承担责任。审稿人失败了,错过了很多问题。《科学》在选择审稿人方面也失败了。8:42 “最后,NASA彻底失败了。”8:42 但科学的过程并没有失败。8:45 讲座结束。提问——这个事件会改变科学吗?雷德菲尔德:如果你在博客上谈论它,你就标记了这是你的想法。8:47 观点:同行评审就像民主(正如丘吉尔所描述的),很糟糕,但却是我们所拥有的最好的。8:48 雷德菲尔德:很多“严重站不住脚”的东西被发表了,所以我们不必担心扼杀科学。8:49 砷生命的想法“不太可能为真”,但“一个可以接受的假设”。你总是会爱上自己的想法。“这是科学的终极快感。”但你需要自律来检验你的假设,看看它是否是错误的。8:52 好了,各位。晚安!













