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细菌加强了新的生命之树

新的生命之树包含了细菌分支中先前未知的物种。

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这棵新的生命之树包含了细菌分支中先前未知的物种。它还包含一个新的细菌分支,候选门类辐射,如上图所示。经麦克米伦出版集团有限公司许可转载:Hug 等人。Nature microbiology/10.1038/NMICROBIOL.2016.48/2016年4月11日

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科罗拉多河洪泛区下方的浅层含水层并非人们首先联想到新生命形式的热点地区。但事实证明,该地区,靠近科罗拉多州莱佛尔镇,是细菌的理想栖息地。

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在加州大学伯克利分校的地球微生物学家吉利安·班菲尔德前往该地点采集水样进行遗传物质分析之前,没有人预料到会发现这样一个充满活力的社群。鉴于她和她的同事们在那里以及其他恶劣环境中(从黄石温泉到智利阿塔卡马沙漠)发现的意外生物多样性,班菲尔德创建了一棵新的生命之树。

这棵树描绘了物种之间的遗传关系,表明科学家们对地球上近三分之一的生命——主要是细菌——视而不见。这是因为世界上大约一半的细菌无法在实验室中培养。班菲尔德和她的同事们通过宏基因组学分析环境来克服这个问题:对每个社群的DNA进行测序,然后拼凑出单个基因组。

班菲尔德说,生命之树展示了“生物体之间的关系”,而这个版本的目标,发表于4月Nature Microbiology杂志上,是“提供一个平衡的取样”。这是一个对生命的新视角,它考虑了超出能在培养皿中生长的多样化可能性。

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