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办公室里充满了皮肤和鼻子的细菌

探索室内微生物群落如何在城市中的办公室各不相同,以及它们与人类微生物组多样性的联系。

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(图片来源:trekandshoot/Shutterstock)我们大多数人每天有高达 90% 的时间在室内度过,这样的数据会让你想在午休时间到户外活动——尤其当你考虑到与你共享工作空间的微生物时。科学家们越来越对与我们共享这些人工环境的细菌、真菌和其他微生物的生态系统感兴趣。因此,Biota Technology 的 John Chase 和他的同事们采集了位于弗拉格斯塔夫、圣迭戈和多伦多的办公室的微生物群落样本。在所有样本中,人类皮肤细菌占捕获基因材料的 25% 到 30%,其次是来自我们鼻腔中细菌的“少量但稳定”的贡献,下次触摸办公室里的任何东西时,不妨想想这件事。

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隔间里的微生物群落

研究人员对室内环境的不同特征——如建筑材料、通风系统、气候控制和人员流动——如何影响微生物的定居种类很感兴趣。他们在每个城市的三个办公室的地板、天花板和一堵墙上安装了采样板。每个采样板上都包含常见的办公建筑材料:涂漆石膏板、天花板砖和地毯。附近的传感器记录了湿度、温度和光照水平。Chase 和他的团队在为期一年的研究中,每季采集一次样本,共采集了四次。他们对每个样本进行了基因测序,生成了宏基因组:样本中所有生物的联合基因组。一些细菌门类,如变形菌门厚壁菌门放线菌门,在三个城市都很常见,但它们的比例不同。弗拉格斯塔夫的微生物种群比其他两个城市更具多样性。

地点,地点,地点

人类微生物组仅是样本的第二大贡献者。大部分基因材料来自研究人员无法识别的来源——但肯定不是来自在人体上生长的东西。Chase 和他的同事们表示,大多数这些微生物可能来自办公室外部的环境。在样本中,城市之间的差异足够明显,以至于机器学习算法能够 85% 的时间正确地将样本与某个城市关联起来——这个成功率比随机猜测高出 2.67 倍。当然,这并不一定意味着每个城市的微生物种群都比其近邻有明显差异。“我相信我们看到的差异是区域性的差异,”Chase 说。研究中的三个城市都位于气候和生态系统明显不同的地区。由于室外微生物也是室内微生物群落的最大组成部分,因此办公室微生物组带有区域特色是合乎情理的。距离较近的城市差异可能不大。该团队本周在《mSystems》杂志上发表了他们的研究结果。“我们研究了不同的环境,因此很难说一个气候需要有多大的差异才能看到室内微生物群落的差异,”Chase 说。

初期阶段

这项研究首次审视了地理位置如何影响我们居住的微生物,即使是在室内,但该领域的观察者警告说,现阶段不宜得出确切的结论。九个办公室提供了足够大的样本来提出一些有趣的问题,但微生物组研究员 Curtis Huttenhower(他对这项研究发表了评论)期待看到样本量更大的后续研究。“我们最近在研究人类微生物组的独特性,即使是在几百人的群体中工作,也很难确定该群体个体受试者的独特性在多大程度上可以推广到更大的群体,”他说,“因此,样本量非常非常小,只有几个地点中的几个办公室,这还只是初期阶段。”

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