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病毒通过做它们最擅长的事情(进化)来显示出创造药物的希望 (Viruses Show Promise for Creating Drugs By Doing What They Do Best: Evolving)

试管进化将蛋白质开发速度提高了100倍,利用病毒轻松创造定制蛋白质。

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新闻要点:试管进化迅速传播开来:一项新研究展示了如何利用病毒的自然选择优势来创造定制蛋白质。哈佛大学的研究人员表示,他们的新技术比传统方法快一百倍,在8天内完成了200代蛋白质的开发,并且至关重要的是,一旦设置好,它就不需要研究人员的干预:就像进化版的慢炖锅。虽然这主要是研究人员的福音,但未来它可以加速定制蛋白质在新药中的生长。

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科学家们已经利用病毒的力量开发出一种进化定制蛋白质的方法。

运作方式

  • 研究人员首先设置一个具有恒定液体流和细胞的容器,然后加入病毒,病毒开始感染细胞。病毒携带研究人员想要优化的蛋白质的基因——例如,他们想要改进的一种部分有效的药物。

  • 蛋白质开始发挥作用,切割或改变研究人员可能希望它们作用的其他任何分子。(这可能是一些类似霍乱毒素或添加到液体中的油分子,或者可能是细胞中天然存在的分子。)当蛋白质工作时,它们也会激活允许病毒复制自身的基因的转录。

  • 速度是关键:蛋白质必须以高于特定速率工作,否则病毒将无法及时感染以接管新细胞并避免被冲走。因此,如果候选蛋白质不能快速发挥作用以保持其病毒的传染性,它就会被容器中流出的液体从基因库中冲走。

  • 为了创造大量新的、可能更快的变种,液体中的一种化学物质会使蛋白质发生突变,然后循环重复。最终,唯一留下的蛋白质是那些在指定任务中最快的——因此也是最适合的。

背景是什么?

  • 在试管中模拟进化以制造定制分子——“定向进化”——在20世纪90年代初问世。它借鉴了这样的想法:如果暴露在严峻的新环境中,细胞就会进化出使其能够生存的蛋白质和其他生物分子——例如,能够对抗感染或消化石油泄漏的酶。然后,研究人员可以收集进化后的酶用于自己的目的,这些目的范围广泛,从开发洗涤剂(市场上第一个进化产品是分解污渍的酶)到治疗癌症。

  • 大多数技术都需要大量工作:研究人员将数百或数千个候选蛋白质的DNA插入细胞中,然后观察哪些成功,手动移除那些无助于细胞更快生长或更好分解污渍的候选者。然后,他们使DNA发生微小突变,引入遗传变异,然后重复这个循环。现在,这个过程的很大一部分可以轻松地由机器完成,除了选择步骤,而这正是哈佛团队改进的地方。

参考文献:Esvelt . A system for the continuous directed evolution of biomolecules. Nature. doi:10.1038/nature09929

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