超级细菌已经出现。几十年来被征服的微生物正在缓慢变异，以抵抗我们的药物防御。在美国的医院里，细菌感染每年使近200万人患病，并导致9万人死亡。在受感染的患者中，超过70%的细菌已对一种或多种抗生素产生耐药性。更不祥的是，以前只在医院发现的耐药菌株已在学校、监狱和陆军训练中心等社区环境中出现。
艾滋病毒（HIV）是一个较新的威胁，它仍在朝着耐药性变异。一些研究表明，在美国新感染的患者中，有10%到20%对至少一种艾滋病毒药物具有耐药性，而在2005年，纽约市一名感染者出现了一种罕见的、对多种药物都耐药的菌株。在东欧和中亚，耐药结核病的菌株正在增加，而随着一种又一种药物对这种寄生虫变得无效，疟疾已卷土重来。世界卫生组织大会最近将微生物耐药性列为全球健康的三大威胁之一。
耐药性不仅限于人类病原体。已在亚洲感染了100多人的新禽流感菌株，其中一半以上死亡，这可能成为下一次大流行病。减缓其传播的一种方法是用阿曼他定（一种用于人类的抗病毒药物）治疗受感染的禽类。但中国农民似乎广泛且不加区别地使用了这种药物，导致某些地区的某些禽类出现了耐药性流感菌株，使治疗失效。
到目前为止，这种禽流感病毒还不能轻易感染人类，而且只能通过与受感染禽类密切接触而感染。但是，如果没有有效的药物来对抗禽类感染，将有更多的流感感染禽类与人类接触，从而增加了流感发生人际传播的突变风险。
在新兴国家，非营利组织与比尔及梅琳达·盖茨基金会及其他组织合作，致力于解决各种传染病，支持几十项开发新的和改进的疫苗和抗生素的努力，以及改进预防疾病传播的方法。几个最近资助的小型项目采取了全新的方法来对抗耐药性。中国的一位研究人员希望研制一种药物，该药物可以靶向引起肺结核和乙型肝炎的病原体赖以生存但对人类并非必需的人体细胞的部分。
目标是开发一种能使患者身体对病原体完全不适宜的治疗方法。另一个项目正在开发能增强整体免疫力、降低感染易感性的药物。
尽管有这些努力，但应对耐药微生物的短期解决方案是更多的药物。正如化疗经常需要多种药物来对抗癌细胞的耐药性一样，针对某些病原体的成功抗菌治疗需要联合用药。其理念是在微生物生命周期的不同阶段对其进行靶向，从而最大限度地减少其进化出对抗药物的防御并产生耐药性的能力。制药公司在开发新抗生素方面进展缓慢，大多数时候只是对现有旧抗生素进行细微的化学修饰。
然而，治疗艾滋病毒耐药性的药物研发前景令人鼓舞。新药Fuzeon靶向艾滋病毒与细胞膜结合的位置，阻止其进入，但需要每天注射两次。Panacos制药公司正在开发一种口服药物PA-457，该药物能极大地干扰病毒在细胞内的成熟过程，以至于新释放的病毒颗粒无法成功感染细胞。
至于疟疾，该寄生虫几乎已对所有治疗方法产生耐药性。一种有效的植物性疗法——青蒿素——是存在的，但它对撒哈拉以南非洲等贫困地区来说过于昂贵。印度和泰国的科学家正在测试一种合成版本，其成本更低，生产也更容易。尽管对青蒿素相关药物的联合疗法抱有乐观态度，但最近一项研究发现，疟疾寄生虫可能仅通过一个简单的突变就可能对青蒿素产生耐药性，这给这种乐观情绪蒙上了一层阴影。
与感染的战争已有数千年的历史，但在过去几十年里，这场军备竞赛已升级。“我们正试图领先一步，”哈佛大学公共卫生学院院长巴里·布鲁姆说。
巴里·布鲁姆是哈佛大学公共卫生学院的教务长。
我们目前面临的最严重的传染病威胁是什么？B：
禽流感爆发的可能性。可怕的是，我们对禽流感没有免疫力。我们每年都会发生流感爆发，但这些是我们已经产生了免疫力的病毒。1918年，流感在全球造成2000万至4000万人死亡，因为我们对那种流感（大流行的最初来源）没有免疫力。
我们如何准备？B：
我们不知道（人类）病毒是什么——因为它还没有发生，所以很难为此做准备。我们知道鸟类的病毒版本。我们有几个（基因）序列，并且我们正在为这些鸟类病毒制造疫苗。但想想花几百万美元去制造一种尚未出现的病毒的疫苗。
亚洲可能出现的病毒
能被控制住吗？B：
这是令人头疼的问题：如果发生了，我们将如何知道？该地区没有小的疾病预防控制中心。世界卫生组织有一些项目，各国政府也有，但在汇总信息以快速应对疫情方面，没有人真正起作用。
禽流感有治疗方法吗？B：
一种叫做达菲（Tamiflu）的药物可以减缓病毒，但不能预防。如果爆发，我们将需要它，但它仍然拥有专利（罗氏制药公司），而且价格昂贵。美国目前储备的量仅够约四分之一人口使用。我们需要更多。亚洲没有。
在治疗病毒感染方面的技术水平如何？B：
我们没有很多抗病毒药物。病毒利用细胞的机制来运作，所以很难找到一种不干扰细胞正常功能的药物。我们应该加大这方面的研究力度。细菌更容易对付，因为你可以关闭细胞内的机制。
耐药性问题的严重程度如何？B：
这是一个巨大、新兴且威胁性的问题。我们过去认为，如果我们有了疫苗或药物，事情就解决了，但现在我们知道病原体会变异。如果你施加压力去杀死正常变异体，你就允许突变体生存。我们通过将抗生素用于我们食用的猪来导致耐药性。在医院里，葡萄球菌感染对万古霉素的耐药性越来越强，并且对青霉素和甲氧西林也已经产生了耐药性。如果我们失去了万古霉素，我们就麻烦了。
我们的技术能否改进？B：
我认为我们会跟上。每次出现耐药性问题，都会有两到三年的滞后期。
生物恐怖主义是一个真实存在的威胁吗？B：
自2001年9月11日以及随后一个月的邮政炭疽病事件以来，我们对威胁的认识提高了。美国国立卫生研究院和疾病控制与预防中心已加大了对可能用于生物恐怖主义的病原体的研究力度。我是乐观的。但哪家公司会为一个尚不存在的病原体投资数百万美元？一个解决方案是由政府和基金会提供购买保证。
