别忘了意大利的深层结构！来源：Rita Molnar 抱歉，我一直没时间写博客，但我认为至少要指出的是，Peter Ralph 博士和 Graham Coop 博士关于同源片段以及欧洲人口和历史的论文已在《PLoS Biology》杂志上最终定稿，题目为《The Geography of Recent Genetic Ancestry across Europe》。我一年来一直了解这些结果的大致情况，坦率地说，我还在消化它们。媒体的炒作会来来往往，出现“所有欧洲人都有关联”这类真实但某种程度上微不足道的标题，但这类遗传学探究人口之间关联性的研究的后果将是长远的。至少应该是这样。但在我继续说下去之前，如果你觉得这篇论文本身有点吓人（尽管我认为正文对一篇统计遗传学论文来说是相当易读的），可以看看Carl Zimmer 的精简版。这类结果很可能引起混淆，所以请注意 Graham Coop 一直在 Carl 的博客（以及其他地方）上发表评论（你也可以随时在Twitter 上给他发消息）。此外，他还有一个非常易读的常见问题解答。Coop 博士在 Twitter 上告诉我，明天还会有更新！特别是论文中有一个我注意到的方面，即大多数国家之间，任何两个个体之间相对较短但可检测的片段（约 10 cM），并不能证明近期谱系亲缘关系，而是更深层的历史过程。至于我之前对这篇论文的暗示：每一个对罗马帝国人口和社会问题感兴趣的历史学家都需要阅读这类著作。原因是意大利的特定发现，它似乎表现出大量深层的地方人口结构。这与其他欧洲国家形成对比，后者相对均质化，以至于斯拉夫民族在某种程度上已国际化。尽管几十年来（得益于 L. L. Cavalli-Sforza）对意大利人进行了遗传学研究，但这却是第一项将这一特殊性与其他欧洲人进行比较的工作。这是因为 Ralph & Coop 指出，其他衡量遗传差异的指标（例如，利用高密度 SNP 芯片进行的 PCA）往往会捕捉到更深层的时间历史和史前事件。相比之下，Ralph & Coop 关注的是从共同祖先那里作为一个整体继承下来的基因组片段，这些片段的完整性在几代人的重组过程中会迅速衰减。尽管这种关注遗传片段的技术很强大，但其时间深度也较浅。我将引用作者们关于意大利的讨论。
除了意大利人与他们自身以及与其他欧洲人之间共享的极少数遗传共同祖先外，我们还看到了意大利内部显著的现代亚结构（即图 2），它早于大部分共同祖先，并估计意大利与其他人群之间共享的大部分共同祖先比大约 2,300 年前（图 S16）还要古老。还请记住，大多数人群在与意大利人共享的基因块数量方面没有显示出亚结构，这意味着其他人群与意大利共享的共同祖先早于这些其他人群的分化。这表明意大利内部存在显著的古老亚结构和庞大的人口规模，其强度足以使意大利内部的不同群体共享的近期共同祖先与现代不同的国家一样少，这种亚结构在迁徙时期并未均质化。这些模式部分可能也反映了意大利的地理隔离以及来自不同来源的长期定居历史。
后一种观点是经典的观点，即罗马时期，尤其是来自东地中海的移民取代了土著意大利人。希腊语名字在罗马等地大量出现的铭文和文字证据被用来支持这一论点。我对这些数据表示怀疑，因为古代奴隶和城市无产者通常生育率较低，而且城市本身可能就是人口漏斗。我更倾向于认为，现代意大利人遗传学上主要的东方影响来自于大希腊时期的希腊殖民，因为尽管他们的文明以城市为中心，但希腊人确实从事农业。相反，
我倾向于认为，罗马帝国灭亡后，意大利在欧洲大陆上是独一无二的，因为尽管它有所衰退，但由于高人口密度，它保持了地方区域认同。
在罗马帝国灭亡后的其他领域（伊比利亚、法国和英国）广阔地区，基因谱系广泛的汇聚可能反映了社会的瓦解、人口的崩溃和局部的动荡。检验这一假设的真正方法是当这些方法扩展到世界其他地区，特别是地中海南部。埃及和黎凡特应该会表现出更像意大利的模式，因为这些地区与古代没有深层断裂。关于这篇论文还有很多话要说。但我觉得意大利的这个结果就像一个突出的拇指，值得我们关注。Ralph & Coop 建议需要与人类学家和历史学家合作。确实如此。引用： Ralph P, Coop G (2013) The Geography of Recent Genetic Ancestry across Europe. PLoS Biol 11(5): e1001555. doi:10.1371/journal.pbio.1001555
