对于读者发送到 Loom 的许多评论，我一直沉默不语。我的沉默并非带有敌意——这是因为我旅行太多、杂志写作太多，以及与两个年幼女儿在一起的生活所带来的典型睡眠不足。事实上，阅读评论是我最喜欢做的事情之一。举个例子，今天 talkdesign.org 的 Nick 探讨了近期两篇帖子主题之间的联系：细菌对人造污染物的持续适应和生物学教育中充斥着创造论者的干扰：[节选] 好了，我没有诗，但我想提一下，分解代谢途径的演化是现代“不可约简复杂性”演化的完美例子，正如您将回忆起的，这正是智能设计论者声称无法演化的东西。(1) 这些分解代谢途径通常会分解人类最近才引入环境的“外源性”化合物。(2) 这些化合物通常是持久性毒素。有时它们是杀虫剂或除草剂，或者是炸药等其他有害化合物的副产品。(3) 对降解途径演化的许多研究都是由军事资助的实验室进行的，因为军队在储存化学武器、炸药等的军事基地面临严重的污染问题。(4) 降解途径通常在分解过程中需要多种蛋白质。化合物通常包含例如被氯等紧密结合的原子保护的芳香环，在产生无毒的“可食用的”碳链之前，必须先脱去氯然后打开环。一些示例论文：* Copley, S. D. (2000). Evolution of a metabolic pathway for degradation of a toxic xenobiotic: the patchwork approach. Trends in Biochemical Sciences V25(N6): 261-265. 来源：http://www.sciencedirect.com/science/journal/09680004 * Johnson, G. R., Jain, R. K. and Spain, J. C. (2002). Origins of the 2,4-Dinitrotoluene Pathway. Journal of Bacteriology 184(15): 4219-4232. 来源：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=PubMed&list_uids=12107140&dopt=Abstract * (莠去津途径演化) Sadowsky, M. J., Tong, Z., de Souza, M. and Wackett, L. P., 1998. AtzC is a new member of the amidohydrolase protein superfamily and is homologous to other atrazine-metabolizing enzymes. J Bacteriol. 180 (1), 152-158. 网址：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=PubMed&list_uids=9422605&dopt=Abstract * (莠去津途径演化) Seffernick, J. L. and Wackett, L. P., 2001. Rapid evolution of bacterial catabolic enzymes: a case study with atrazine chlorohydrolase. Biochemistry. 40 (43), 12747-12753. 网址：http://pubs3.acs.org/acs/journals/doilookup?in_doi=10.1021/bi011293r 您链接到的 McAdams 等人的 Nature Reviews Genetics 论文提到了这类研究，还有去年 Lenski 等人在 Nature 上发表的关于“不可约简复杂性”系统演化的计算机模拟论文。McAdams 等人没有错过机会讽刺智能设计：==== 这些实验尤为宝贵，因为它们表明，突变和选择等直接的进化机制可以在不 invoking ‘intelligent design’ 的情况下，使生物体的复杂性稳步提高。==== 到目前为止，智能设计论者似乎认为计算机模拟对于 [插入晦涩的吹毛求疵] 是无关紧要的，并且他们似乎希望通过完全忽略关于外源性化合物分解代谢途径演化的研究，让这些研究消失。我不会长期押注于他们的策略。但话说回来，智能设计论者完全诉诸公众，并像躲避瘟疫一样避开与相关科学专家的讨论，而他们的策略最近似乎取得了一些成功。我很高兴至少有 Carl Zimmer 这样的人在帮助传播信息。Nick [节选] 感谢你的联系和提供的资料，Nick。
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