作者：Elizabeth Kittrie，美国国立卫生研究院数据科学高级顾问秉承开放科学的精神——这是一个旨在使科学研究的数据和其他信息供所有人使用的运动——美国国立卫生研究院邀请您投票，帮助我们决定在参与开放科学奖角逐的项目中，哪些是最具创新性且最有可能产生最大影响的。您的投票在确定进入最终选拔的三个决赛者以及最终赢得 230,000.00 美元大奖的项目方面起着至关重要的作用。在此次竞赛中，六个决赛团队（每个团队至少包含一名美国研究员和一名国际研究员）正在利用开放数据来改善人类健康。开放数据是指公众可以访问且可供任何人重新使用的数据。美国卫生与公众服务部（NIH 的母机构）是全球众多已公开提供医疗保健数据的政府机构之一。您可以通过healthdata.gov门户找到三千多个公开可用的健康数据集。
开放科学奖决赛团队的代表于去年五月齐聚华盛顿特区举行的第七届年度Datapalooza活动。摄影：Edward Brown/AcademyHealth 尽管科学确实是一项全球性事业，常常涉及不同国家机构的科学家团队，但科学研究的资金通常与来源国挂钩。为了克服这一障碍，美国国立卫生研究院和总部位于英国的Wellcome Trust，并在霍华德·休斯医学研究所的额外资助下，共同创建了开放科学奖，这是一项展示资助机构如何进行国际合作的创新举措。通过要求每个团队至少包含一名美国成员和一名国际成员，该奖项旨在促进全球开放科学创新者之间建立新的合作关系，造福全球研究界和公众。该奖项于 2015 年宣布，目前的六个决赛项目是从全球 45 个国家的 96 个提交项目中选出的。以下是六个决赛项目（排名不分先后）的一些背景介绍。OpenTrialsFDA：促进更好地访问向美国食品药品监督管理局提交并由其提供的药物审批文件 OpenTrialsFDA 应用程序通过公开提供药物审批文件的内容，使查找美国食品药品监督管理局 (FDA) 的临床试验数据变得更加容易。这些审查文件通常包含从未在学术期刊上发表过的临床试验信息。OpenTrialsFDA 允许用户以比 Drugs@FDA 公开文件数据库更用户友好、更易于导航的方式查看研究的原始结果，例如未发表的数据或看起来比实际更重要的数据。果蝇大脑天文台：通过连接果蝇大脑相关的数据，使研究人员能够更好地进行精神和神经疾病建模 理解人类大脑的功能和疾病，可以说是神经科学领域最大的挑战。为了帮助应对这一挑战，研究人员转向研究其他生物体中较小但足够复杂的大脑。果蝇大脑天文台允许使用果蝇大脑扫描的数据作为模型，来研究人类神经和心理障碍。果蝇大脑天文台还集成了人类大脑的健康和疾病模型供研究。通过使用计算疾病模型，研究人员可以进行在当前基因技术下体内难以实现的靶向修改。该平台是模块化的，因此可以扩展到小鼠、斑马鱼和其他实验动物。这些能力有可能显著加速开发强大的新方法来预测药物对神经回路功能的影响。MyGene2：通过彻底开放数据共享加速基因发现 全世界约有 3.5 亿人，其中超过 3000 万美国人患有罕见病。其中大多数罕见病是所谓的孟德尔病，这意味着单个基因的突变会导致疾病。此类疾病的例子包括镰状细胞贫血症、泰-萨克斯病、囊性纤维化和 Xeroderma Pigmentosa。已有超过 7000 种孟德尔病被描述，但迄今为止，科学家只将其中一半的疾病与特定基因联系起来。因此，近 70% 接受临床检测的家庭缺乏诊断。MyGene2 是一个网站，让患有孟德尔病的家庭可以轻松免费地与世界各地的其他家庭、临床医生和研究人员共享健康和遗传信息，以便进行匹配。开放神经影像实验室：通过支持大脑影像数据的协作标注、发现和分析来推进大脑研究 互联网上有海量的大脑影像数据，其中包含大脑解剖结构、连接性和功能等不同类型的信息。这些数据代表了巨大的资金投入、数据收集、处理工作以及成千上万参与者的善意。一个名为 BrainBox 的基于 Web 的应用程序的开发，使得围绕公开可用的大脑影像数据的标注、发现和分析的分布式协作成为可能，从而产生对精神疾病等关键社会挑战以及我们认知结构见解。协作者可以发送信息、发表评论并突出显示图像中的特定位置，并且可以限制访问权限，允许协作者在不修改图像的情况下查看图像——使用类似于 Google Docs 的功能。Open AQ：通过整合全球数据提供关于空气质量差的实时信息 空气质量差导致全球八分之一的死亡，但世界上污染最严重的地方研究不足，阻碍了科学进步。可访问和及时的空气质量数据对于推进科学界对抗空气污染的斗争至关重要，也是健康研究的必要条件。OpenAQ 平台每 10 分钟收集一次数据，并允许用户查看存储的数据和比较地点。迄今为止，OpenAQ 社区已从 41 个国家的 4,569 个地点收集了 32,929,735 次空气质量测量。数据来自 55 个政府级和研究级来源。病原体监测和流行病学调查的实时进化追踪：允许分析埃博拉、中东呼吸综合征冠状病毒和寨卡病毒等新发疫情 Nextstrain 项目是一个用于实时追踪病原体进化的应用程序，这在当前高流动性的时代至关重要。接触者追踪是在没有疫苗的情况下对抗病毒的主要方法；对埃博拉等病毒进行基因组测序可以确定每个菌株的共同突变和系统发育，使现场流行病学家能够以更细致的方式追踪接触者。为了促进对寨卡病毒等病原体活跃疫情的治疗，Nextstrain 能够在几天内显示分子流行病学。它还旨在易于扩展，并易于现场团队理解。该项目使用一个在线可视化平台，在该平台上，统计分析的输出可以在样本采集后几天内被公共卫生官员用于流行病学洞察。您可以通过访问 www.OpenSciencePrize.org，查阅列出的项目，并投票选出您希望进入竞赛决赛轮的三项，来为塑造生物医学研究的未来贡献一份力量。投票时间为 2016 年 12 月 1 日至 2017 年 1 月 6 日太平洋标准时间晚上 11:59。获得公众投票最多的 3 个原型将进入由美国国立卫生研究院和Wellcome Trust的科学专家和评委组成的评审团的最终评审轮。由合作方共同资助的、唯一的大奖获胜团队将于 2017 年 3 月公布。
